Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Eftud2O08810 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms