Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm3239L7N2D9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm3239L7N2D9 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3239L7N2D9 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3239L7N2D9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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