Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20939L7N243 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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