Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21310J3QQ23 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21310J3QQ23 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms