Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms