Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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Top6blJ3QMY9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Top6blJ3QMY9 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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