Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn20G5E8X0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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