Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm17333C6EQI3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17333C6EQI3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms