Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD8

Mfap1a, Microfibrillar-associated protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1aC0HKD8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mfap1aC0HKD8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mfap1aC0HKD8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mfap1aC0HKD8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Mfap1aC0HKD8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mfap1aC0HKD8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mfap1aC0HKD8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.5 ms