Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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