Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usf3B2RUQ2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usf3B2RUQ2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms