Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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