Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms