Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms