Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Pramef6A2A8M8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Pramef6A2A8M8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Pramef6A2A8M8 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Pramef6A2A8M8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Pramef6A2A8M8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pramef6A2A8M8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms