Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcniQ9Z2V9 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcniQ9Z2V9 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms