Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ubl3Q9Z2M6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ubl3Q9Z2M6 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ubl3Q9Z2M6 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ubl3Q9Z2M6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ubl3Q9Z2M6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ubl3Q9Z2M6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ubl3Q9Z2M6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms