Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfrp4Q9Z1N6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms