Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms