Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rabgef1Q9JM13 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms