Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Hmgn5Q9JL35 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Hmgn5Q9JL35 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Hmgn5Q9JL35 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmgn5Q9JL35 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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