Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms