Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Csnk1dQ9DC28 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Csnk1dQ9DC28 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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Csnk1dQ9DC28 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Csnk1dQ9DC28 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Csnk1dQ9DC28 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
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Csnk1dQ9DC28 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Csnk1dQ9DC28 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Csnk1dQ9DC28 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Csnk1dQ9DC28 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Csnk1dQ9DC28 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Csnk1dQ9DC28 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1dQ9DC28 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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