Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Med27Q9DB40 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Med27Q9DB40 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Med27Q9DB40 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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