Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim23Q9DAL0 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms