Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Alkbh4Q9D8F1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Alkbh4Q9D8F1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Alkbh4Q9D8F1 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Alkbh4Q9D8F1 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Alkbh4Q9D8F1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Alkbh4Q9D8F1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Alkbh4Q9D8F1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Alkbh4Q9D8F1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Alkbh4Q9D8F1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Alkbh4Q9D8F1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
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Alkbh4Q9D8F1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Alkbh4Q9D8F1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Alkbh4Q9D8F1 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
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