Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MsraQ9D6Y7 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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MsraQ9D6Y7 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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MsraQ9D6Y7 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsraQ9D6Y7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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