Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Borcs6Q9D6W8 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Borcs6Q9D6W8 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Borcs6Q9D6W8 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms