Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tubgcp4Q9D4F8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Tubgcp4Q9D4F8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Tubgcp4Q9D4F8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Tubgcp4Q9D4F8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Tubgcp4Q9D4F8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tubgcp4Q9D4F8 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tubgcp4Q9D4F8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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