Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Pramef12Q9D2F1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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