Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Exo5Q9CXP9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Exo5Q9CXP9 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms