Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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