Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ddx28Q9CWT6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ddx28Q9CWT6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ddx28Q9CWT6 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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