Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cnot11Q9CWN7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms