Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Otud1Q9CUB6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms