Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nudt21Q9CQF3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms