Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
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Rnaseh2cQ9CQ18 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
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Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnaseh2cQ9CQ18 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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