Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim26Q99PN3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms