Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim3Q99PE5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms