Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms