Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ciao1Q99KN2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms