Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pacsin3Q99JB8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Pacsin3Q99JB8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Pacsin3Q99JB8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms