Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Med28Q920D3 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms