Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hps3Q91VB4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms