Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc8Q8VD72 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc8Q8VD72 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc8Q8VD72 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc8Q8VD72 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc8Q8VD72 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc8Q8VD72 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ttc8Q8VD72 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc8Q8VD72 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc8Q8VD72 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc8Q8VD72 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ttc8Q8VD72 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ttc8Q8VD72 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc8Q8VD72 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc8Q8VD72 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc8Q8VD72 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc8Q8VD72 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc8Q8VD72 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc8Q8VD72 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc8Q8VD72 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc8Q8VD72 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc8Q8VD72 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ttc8Q8VD72 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ttc8Q8VD72 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ttc8Q8VD72 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ttc8Q8VD72 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ttc8Q8VD72 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc8Q8VD72 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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