Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Top1mtQ8R4U6 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms