Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ube3dQ8BX13 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube3dQ8BX13 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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