Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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