Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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H2-M10.6Q85ZW5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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H2-M10.6Q85ZW5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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H2-M10.6Q85ZW5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H2-M10.6Q85ZW5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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