Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Ttc28Q80XJ3 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Ttc28Q80XJ3 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Ttc28Q80XJ3 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Ttc28Q80XJ3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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